Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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GABRA6Q16445 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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