Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS72Q15906 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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