Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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