Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUM3Q15397 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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