Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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UBE3CQ15386 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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UBE3CQ15386 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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UBE3CQ15386 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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UBE3CQ15386 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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UBE3CQ15386 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBE3CQ15386 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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