Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PTPRKQ15262 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PTPRKQ15262 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PTPRKQ15262 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTPRKQ15262 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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PTPRKQ15262 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRKQ15262 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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