Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ERV3-1Q14264 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ERV3-1Q14264 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms