Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CBFBQ13951 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms