Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEUROD1Q13562 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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