Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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TCIRG1Q13488 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TCIRG1Q13488 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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