Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AVIL-201ENST00000257861 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
UBE2V1Q13404 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms