Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM2Q13029 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM2Q13029 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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