Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB40BQ12829 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB40BQ12829 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RAB40BQ12829 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RAB40BQ12829 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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