Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GALNT1Q10472 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GALNT1Q10472 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms