Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms