Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUCB1Q02818 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms