Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 PSMC1-202ENST00000543772 1389 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNB1Q02641 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC00331-201ENST00000446391 376 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NAA60-220ENST00000573580 758 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC009061.2-203ENST00000635000 1462 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC008514.2-201ENST00000522096 1337 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CACNB1Q02641 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms