Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
NHLH2Q02577 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms