Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
IFITM3Q01628 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms