Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SKOR1P84550 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms