Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms