Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
JAG1P78504 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
JAG1P78504 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
JAG1P78504 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
JAG1P78504 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms