Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSC2P49815 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSC2P49815 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSC2P49815 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms