Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGIRP43119 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms