Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GDF5P43026 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GDF5P43026 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms