Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP8P40818 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP8P40818 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP8P40818 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms