Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZEB1P37275 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms