Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms