Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms