Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HLA-DMAP28067 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms