Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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PTPRBP23467 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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