Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms