Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EXTL3O43909 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms