Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPN9O14815 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPN9O14815 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPN9O14815 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPN9O14815 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPN9O14815 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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