Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AGK-201ENST00000355413 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VGLL3A8MV65 ADGRG5-202ENST00000349457 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms