Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C9orf118A6NHY6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms