Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms