Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM187AA6NFU0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms