Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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