Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS3Q9UNS2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS3Q9UNS2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms