Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms