Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRT82Q9NSB4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms