Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRA1Q9HD15 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms