Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms