Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRC3Q9BY71 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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