Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAGR1Q9BTK6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms