Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CRACR2AQ9BSW2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms