Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRIQ1Q96JM4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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