Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP13Q92995 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP13Q92995 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
USP13Q92995 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP13Q92995 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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