Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113Q902F9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms